重複コメントは受け付けなくなったらしいけど

livedoor Blog 開発日誌:重複コメントを受け付けないようにしました

あと、Movable Type 2.661から飛んできたトラックバックが「多重に」認識されてます。
おそらく、こっち（Livedoor Blog）の不具合かと。